| Serie 1 |
| Antony Gabriel Saez Bautista | Atletismo DANUD - Ayacucho | | 4:00.25 | 1 |
| Jhon Gobin Huaman Matamoros | Municipal Pampas | | 4:01.30 | 2 |
| Julio Luis Chacón Ordoñez | Deportivo Running-K Cusco | | 4:02.86 | 3 |
| Sebastián Rene Poma Del Campo | Atlético Asociación San Isidro de Chipre | | 4:12.18 | 5 |
| Isaac De Jesus Peña Avile | Escuela Naval de Perú | | 4:21.25 | 6 |
| Manuel Andree Monge Sanchez | Escuela Militar | | 4:31.76 | 8 |
| Dean Ayrton Reyes Vallejos | Atlético Asociación San Isidro de Chipre | | 4:58.57 | 11 |
| Piero Victor Peralta Cordova | Faustino Maldonado | | 5:13.29 | 15 |
| Cristhian Samuel Escobar Noe | Monteprincipe | | DNS | |
| Diego Alfredo Valencia Peña | Deportivo Centinelas SAC | | DNS | |
| Diego Valentin Ore Herrera | Atlético Deportivo Chaucayan | | DNS | |
| Ederick Steve Castro Carranza | Escuela Naval de Perú | | DNS | |
| Serie 2 |
| Gino Yordani Flores Quispe | Deportivo Athletic Puno Runners | | 4:06.84 | 4 |
| Jasson Franklin Yaranga Quiroz | Escuela Militar | | 4:26.90 | 7 |
| Brad Rony Lugo Toledo | Escuela Naval de Perú | | 4:54.51 | 9 |
| Miguel Alejandro Matsui Almengor | Escuela Naval de Perú | | 4:54.81 | 10 |
| Julio Alexander Chuchon Aylas | Escuela Naval de Perú | | 4:58.69 | 12 |
| Wiliam Portocarrero Torres | Escuela Naval de Perú | | 5:02.94 | 13 |
| Juan Jose Chavez Rodriguez | Escuela Naval de Perú | | 5:12.19 | 14 |
| Victor Fabrizzio Espinoza Nicacio | Escuela Naval de Perú | | 5:17.65 | 16 |
| Erick Herbert Christopher Sinchitullo Ortiz | Escuela Naval de Perú | | 5:36.60 | 17 |
| Luis Fernando Ventura Ortega | Escuela Formación Deportiva | | 6:00.66 | 18 |
| Cristiano Emmanuel León Flores | Escuela Formación Deportiva | | 6:08.80 | 19 |
| Anderson Gabriel Rebolledo Moreno | Escuela Militar | | DNS | |
| Leonardo Fabio Mozombite Mozombite | Deportivo Estudiantil República de Venezuela | | DNS | |
| Clasificación final |
| Antony Gabriel Saez Bautista | Atletismo DANUD - Ayacucho | | 4:00.25 | 1 |
| Jhon Gobin Huaman Matamoros | Municipal Pampas | | 4:01.30 | 2 |
| Julio Luis Chacón Ordoñez | Deportivo Running-K Cusco | | 4:02.86 | 3 |
| Gino Yordani Flores Quispe | Deportivo Athletic Puno Runners | | 4:06.84 | 4 |
| Sebastián Rene Poma Del Campo | Atlético Asociación San Isidro de Chipre | | 4:12.18 | 5 |
| Isaac De Jesus Peña Avile | Escuela Naval de Perú | | 4:21.25 | 6 |
| Jasson Franklin Yaranga Quiroz | Escuela Militar | | 4:26.90 | 7 |
| Manuel Andree Monge Sanchez | Escuela Militar | | 4:31.76 | 8 |
